かつて組織を裏切った女は、孤独な正義の戦士（ライダー）となった――。

元ショッカーの潜入捜査官・神崎零。彼女は過去の過ちと決別するため、自ら開発した変身ベルトで「ミニスカ仮面ライダー0号」となり、孤独な戦いを続けていた。

しかし、旧アジトへの潜入任務で待っていたのは、冷酷な蛇型怪人の罠と、絶望的な拘束。絶体絶命のピンチに陥る0号のもとへ、相棒・氷室瞳（1号）が駆けつける！
絆を取り戻した二人の前に、今度は0号の戦闘データを完コピした謎の刺客「シャドウ」が立ちはだかり――！？

怒涛のアクション、忍び寄る洗脳と罠、そして熱いダブルライダーの絆！
少女たちの正義をかけた激闘の物語が、今始まる！